おぉ。コメント頂いたとおりEvent.observe()で括ってみたら種々の問題が一気に解決しました。しかし、不思議なことが１点。Event.observeの追加により動作するようになったのですがあらためてその挙動を調べてみようと思い、再度このEvent.objserveを取って実行してみたのですが不思議なことにもう再現しませんでした。修正を入れる前のIE6の挙動は記憶を頼りに書き出してみると、