イヤー時間かかりました、移行作業。phpのバージョンアップを図ったのがトラブルの原因で最新バージョンのv5.2.3はいろいろ問題があるようです。gd関連のオプションをつけて./configureすると/usr/bin/ld: -L: directory name missingなどと言われてコンフィグできず。無理矢理、./configureを修正しなんとかmakeまではしてみたものの、FastCGIがうまく動作せず。何度やってもphp(cli)バージョンしかmakeできませんでした。